Jährliche Archive: 2014

Was ist Blutsverwandtschaft? (RAI Südtirol)

 in ancient DNA / Anthropologie / PopGen  verschlagwortet Fragen / Verwandtschaft von

Folgende Fragen wurden von der Hörerin Maria aus Martell eingesendet und durch Moderatorin Erica Corbellini für „Sie stellen die Frage – wir suchen die Antwort” an mich gestellt (gesendet in der RAI Südtirol Radiosendung „Von zwei bis fünf – Das Magazin am Nachmittag“ vom 5.11.2014 um 15:15, Wiederholung am 6.11. um 9:15): Was versteht man unter […]

 in atDNA / Diskussion-News / DNA-DTC  verschlagwortet Russland von | Öffnen »

Victoria Zavyalova (Russia Beyond The Headlines) berichtet von einem stark wachsenden Markt in Russland für genetische Tests. Ende September will die Atlas Biomed Group ihr Angebot verfügbar machen, welches jenem von 23andMe ähneln zu scheint. Das Unternehmen Genotek bietet ebenfalls ähnliche Tests bereits seit einigen Jahren an. Noch sind die Test in Russland allerdings teurer als internationale Konkurrenz: was um $100-200 erhältlich ist, kostet bei russischen Anbietern $600-800. Interessierte Russen umgehen somit oft das Verbot des Exports von Biomaterial mit Tricks, um die internationalen Angebote nutzen zu können. Russland hatte unter der Sowjetherrschaft einen starken Bann aller genetischen Forschungen inklusive Verfolgung  von Genetikern.

Indizien Genetischer Flaschenhals Aschkenasim und die Meldung in Massenmedien

 in Anthropologie / atDNA / Diskussion-News  verschlagwortet Aschkenasim / Europa / Genetische Geschichte / Juden von

Eine medizinisch ausgerichtete Forschergruppe (Carmi et al. 2014) aus den USA, Belgien und Israel hat in einer Studie 128 Aschkenasim, deren Isolation und Krankheitsbilder untersucht. Ein „Nebenprodukt“ dieser Studie waren populationsgenetische Folgerungen, welche aus einem Vergleich mit den Genomen von 26 Flamen gezogen wurden: diese prognostizieren einen Genetischen Flaschenhals mit ca. 350 Vorfahren dieser Aschkenasim, […]

Bükker-Kultur-DNA in Ungarn (LBK vor 7.000 Jahren): 9 x Y und 84 x mt

 in ancient DNA / Diskussion-News / mtDNA / Y-DNA  verschlagwortet Bandkeramik / Genetische Geschichte / LBK / Neolithik von

Der genetische Hintergrund der Bandkeramischen Kulturen (LBK) und im besonderen der Bükker-Kultur im karpatischen Becken (heute Ungarn) wurde von einem umfangreichen Team von Forschern erkundet (Preprint). Die Migration zu und Kolonisierung von südost- und mitteleuropäischen Landstrichen durch neolithische Bauern aus dem Nahen Osten und dem Kaukasus wird weiter bestätigt, insbesondere durch die Y-Haplogruppen G2a und […]

DNA Chimären: zwei Geschwister in einer Person, Austausch Mutter-Kind

 in atDNA / Diskussion-News von

Diese Meldung ist nicht neu, aber sehr faszinierend. Lydia Fairchild hatte bereits zwei leibliche Kinder und suchte 2002 während der Schwangerschaft des Dritten im US-Bundesstaat Washington um staatliche Beihilfe an, als ihr Mann Jamie Townsend sich von ihr trennte. Sie musste den genetischen Beweis erbringen, dass die beiden Kinder von ihrem Ex-Mann und ihr sind. […]

Vergleich von Illumina and Affymetrix SNP chips für Populationsstudien

 in atDNA / Diskussion-News / PopGen  verschlagwortet chip / SNP von

    Ha et al. 2014 von der Universität Göttingen haben 12 chips untersucht, um deren Fähigkeit der Erfassung der Diversität der europäischen, asiatischen und afrikanischen Bevölkerungen zu vergleichen. Der Affymetrix Axiom GW CHB (1–2 million SNPs) scheint das beste Preis-Leistungsverhältnis zu bieten, während der Illumina Human Omni2.5-8 (>2 million SNPs) für Europa die umfassendsten […]

 in atDNA / Diskussion-News  verschlagwortet Erbfehler / Hutterer / Medizinisch / Selektion von | Öffnen »

Eine Studie welche hauptsächlich bei den amerikanischen Hutterern durchgeführt wurde, hat ergeben, dass jeder Mensch im Schnitt 0.29 (95% interval 0.10-0.83) autosomale rezessive Allelen in sich trägt, welche homozygotisch zu kompletter Sterilität oder lethalen Komplikationen vor der Geschlechtsreife führen. Interessant ist, das dieses Verhältnis scheinbar bei den unterschiedlichsten Eukaryoten ziemlich konstant ist. Die Zusammenarbeit von Forschern an den Universitäten von Chicago und Columbia ist als Preprint auf arXiv verfügbar.

Niederländisches Startup bietet schnelle Sequenzanalysen (VCF)

 in atDNA / Diskussion-News / PopGen  verschlagwortet Datencenter / Genom / IT / NGS / Rechencenter / Sequenzierung von

Das holländische Unternehmen Genalice mit Sitz in Harderwijk bietet mit MAP eine Soft- und Hardwarelösung an, welche es erlaubt die Rohdaten aus einer kompletten menschlichen Sequenzierung (NGS complete human genome as FASTQ) in weniger als 30 Minuten zu analysieren und eine Variantdatei (VCF) zu generieren. Weitere Meilensteine laut Firmenangaben: 100x schnellere Ausrichtung (Alignment) und Kartierung […]

Diversität der italischen Populationen: Umfassende DNA-Studie

 in Diskussion-News / mtDNA / PopGen / Y-DNA  verschlagwortet Diversität / Italien von

Erneut belegt eine Untersuchung, durchgeführt von der Uni Sapienza Roma in Zusammenarbeit mit Instituten in Bologna, Cagliari und Pisa, die Heterogeneität der italischen Bevölkerung. Interessante Forschungen, welche noch deutlich ausgeweitet gehören, denn mitochondriale DNA (0,001% des Genoms) und Y-DNA (1,8 %) sind nicht das richtige Mittel um genetische Diversität umfassend festzustellen. Folgende Studie benutzt Daten […]

 in atDNA / Diskussion-News  verschlagwortet Blut / Speichel von | Öffnen »

DNA Genotek and Seven Bridges Genomics haben eine Studie veröffentlicht, welche beweisen soll, dass Speichelproben bei Verwendung mit Whole Genome Sequencing (WGS) die gleiche Performance wie Blutproben erreichen können. Die Studie wurden beim Human Genome Meeting in Genf als Poster präsentiert: Systematic multi-sample analysis of the effect of sample type (blood vs. saliva) on variant calling confidence for WGS. Die Studie basiert auf den Daten von zwei Familien-Trios und die Unterschiede der Proben bezüglich der feststellbaren Varianten (SNPs und INDELs) wurden ebenso untersucht, wie die Ursachen derselben.