Eine Forschergruppe aus den Niederlanden hat ein interessantes Paper (Lao et al. 2014) veröffentlicht, welches 2.457 Europäer von 23 Lokalitäten in 133.363 bezüglich LD ausgewählten SNPs anhand der genetischen Beziehungen vergleicht. Verwendet werden dabei mehrere Methoden:
- Classical Multidimensional Scaling (MDS) + Mclust analysis using the D distance matrix based on the T1 (Genotype) statistic;
- MDS + Mclust analysis using the distance matrix with the transformed V matrix;
- SPA + Mclust analysis using the original genotype data;
- GemTools analysis using the original genotype data;
- genetic algorithm + AMOVA using the original D matrix;
- genetic algorithm + AMOVA using the V matrix.
